Dass Fledermäuse auch über der deutschen Nord- und Ostsee migrieren, ist durch Zufallsbeobachtungen und punktuelle Erhebungen ebenfalls dokumentiert. Alle heimischen Fledermausarten sind nach dem Bundesnaturschutzgesetz streng geschützt und im Anhang IV der FFH-Richtlinie sowie teilweise in Anhang II der FFH-Richtlinie gelistet. In Genehmigungsverfahren von OWEA ist demnach auch relevant, ob und in welchem Ausmaß ein Kollisionsrisiko für Fledermäuse an den Anlagen besteht.