Der Göttingen-Northeimer Wald ist eine waldbestandene gemorphologisch unterschiedlich aufgebaute Hochfläche. Die zentral gelegene Hochfläche mit bis zu 400 m über NN besteht aus Muschelkalk, im Süden und Norden stehen Platten aus Bausandstein (Buntsandstein) an. Der überwiegende Teil der Landschaft ist von sehr artenreichen, kalkbeeinflußten Buchenwäldern bewachsen. Landschaftsgliedernde und -gestaltende Elemente sind die periodisch wasserführenden Trockentäler, Felsen und die besonders wertvollen Waldränder und -lichtungen mit eingestreuten Feldhecken sowie Acker- und Grünlandflächen.
Der Göttinger-Northeimer-Wald ist gekennzeichnet durch Buchenwald, der forstwirtschaftlich genutzt wird. Nicht bewaldete Bereiche werden ackerbaulich genutzt. Grünlandnutzung findet kaum statt.
Zentrale Bereiche (östlich von Göttingen) des Göttinger-Northeimer Waldes mit artenreichen Kalkbuchenwäldern sind als großflächige, ca. 25% der Landschaftsfläche einnehmende, FFH-Gebiete gemeldet worden. Ebenso ein weiteres Gebiet im Gartetal südlich von Göttingen. Andere Flächen wurden als EU-Vogelschutzgebiete ausgewiesen. Neben den Schutzgebieten sind weitere Waldflächen und/oder besonders trockene und feuchte Bereiche als "National bedeutsame Flächen für den Biotopverbund" erfasst worden.