Evaluation ist notwendig, um die Wirkungen und Erfolge von umgesetzten Maßnahmen überprüfen zu können. Ziel der Evaluationen im Bundesprogramm Biologische Vielfalt (BPBV) ist es, den Projekterfolg zu dokumentieren und Hinweise zu geben, wo weitere Verbesserungen oder Anpassungen bei der Maßnahmenumsetzung erforderlich sind. Unter Projekterfolg wird die Erreichung gesetzter Ziele verstanden. Auf die Formulierung konkreter Ziele in der Projektplanung wird daher viel Wert gelegt. Auch Erläuterungen über das Nicht-Erreichen von Zielen und die Gründe hierfür können wertvolle Hinweise für die Planung und Durchführung zukünftiger Projekte sowie für die Weiterentwicklung des BPBV geben.

Im BPBV sollen laut Förderrichtlinie alle Projekte evaluiert werden. Hierzu hat das BfN 2017 einen Leitfaden zur Evaluation von Projekten im BPBV herausgebracht. Durch den Leitfaden werden allgemeine Standards für die Projektevaluation eingeführt und wird der Fokus auf die Erfassung von Wirkungen (Outcomes) gelenkt. Aktuell wird der Leitfaden überarbeitet, was mit einigen Änderungen zum bisherigen Vorgehen einhergeht. Weiterhin gilt, dass Projektziele messbar formuliert sein sollen.