Um die Kollision mit Windenergieanlagen zu minimieren, sind in der Praxis verschiedenste artenschutzfachliche Vermeidungsmaßnahmen möglich. Dazu zählt zum Beispiel den Anlagenbetrieb zu regulieren, ein Anlocken zu vermeiden oder die Aufwertung von Nahrungsflächen außerhalb des Windparks. Die Wirksamkeit einiger Maßnahmen ist bislang jedoch aus Naturschutzsicht nicht ausreichend untersucht. Ein Vorhaben des BfN entwickelte daher eine Methodik zur Bestimmung der Wirksamkeit und damit des Erfolges ausgewählter Maßnahmen am Beispiel der Artengruppe Vögel (Ergebnisse in der BfN-Schrift 518).

Die Wirksamkeit einiger Maßnahmen ist bislang jedoch aus Naturschutzsicht nicht ausreichend belegt worden. Daher stand im Mittelpunkt eines weiteren Forschungsvorhabens die Lenkungswirkung von Bewirtschaftungsereignissen auf Rot- und Schwarzmilan, die mit Hilfe von Felduntersuchungen zur Raumnutzung und mittels Telemetrie in zwei unterschiedlichen Naturräumen untersucht wurde (Ergebnisse in der BfN-Schrift 669). Die Erkenntnisse bieten trotz der zwischenzeitlich im BNatSchG geänderten Rahmenbedingungen eine wichtige Grundlage für fachliche Diskussionen. 

Die wirksamste Vermeidungsmaßnahme zum Schutz von Fledermäusen vor Kollision, ist die Abschaltung der Anlagen zu Zeiten von hohem Fledermausaufkommen. Neben pauschal festgelegten Abschaltzeiten, gibt es die Möglichkeit mit Hilfe der Software ProBat standortbezogene Abschaltalgorithmen zu berechnen. Die Weiterentwicklung des ProBat Tool wurde seitens BfN unterstützt.