Um die Daten der Schutzgebiete für die Öffentlichkeit leicht nutzbar machen zu können, wurde eine Kartenanwendung entwickelt, die neben der reinen Kartenanzeige weitergehende Funktionalitäten bietet. Mit der Kartenanwendung „Schutzgebiete in Deutschland“ stellt das Bundesamt für Naturschutz umfangreiche Informationen zu Natura 2000-Gebieten, Naturschutzgebieten, Nationalparken, Biosphärenreservaten, Naturparken und Landschaftsschutzgebieten in einfach zu bedienender Form für alle interessierten Nutzer bereit.

Das Auffinden eines bestimmten Schutzgebietes oder des eigenen Wohnortes wird durch die angebotene Suchfunktion besonders einfach gemacht. Neben der kartographischen Darstellung von insgesamt mehr als 20.000 Schutzgebieten auf der Basis verschiedener topografischer Karten können zu jedem angezeigten Gebiet die vorliegenden Sachinformationen abgerufen werden. 

Besonders wertvoll wird die Anwendung durch die Inhalte der Standarddatenbögen der Natura 2000-Gebiete, die über eine Recherchemöglichkeit sowie als Steckbriefe für jedes FFH- und Vogelschutzgebiet in Deutschland zugänglich sind. In der angebotenen Natura 2000-Suche können Suchanfragen nach Naturräumen, Arten, Lebensraumtypen und anderen Kriterien frei kombiniert, die Suchparameter verändert und die Treffer auch mit Kartendarstellung exportiert und gespeichert werden.